中国合格评定国家认可委员会组织机构包括：全体委员会、执行委员会、认证机构技术委员会、实验室技术委员会、检查机构技术委员会、评定委员会、申诉委员会和秘书处。中国合格评定国家认可委员会委员由政府部门、合格评定机构、合格评定服务对象、合格评定使用方和专业机构与技术专家等5个方面，总计63个单位组成。
2021年2月1月，中新网消息，中国合格评定国家认可委员会(CNAS)科研实验室专业委员会日前在北京成立。
产品认证机构认可部
1.负责产品认证、服务认证、审定核查等认可制度和方案研究，及相关领域工作组的牵头管理工作；
2.组织相关机构认可申请受理、评审以及后续的监督、扩项和复评活动，并实施监控。承担部分现场评审工作；
3.负责审查评审材料的完整性和符合性，提交认可评定；
4.负责认证信息的统计与分析，认证机构变更信息的收集和处理，以及认可费用的收缴管理工作；
5.负责相关专业委员会的管理工作；
6.承担对评审员/技术专家进行培训、监督和评价的有关工作；
7.完成中心领导交办的其他工作。
生物化学实验室认可部
1.负责生物、化学类实验室认可制度和方案研究，及相关领域工作组的牵头管理工作；
2.组织海关、食药、生态环境、卫生健康、农村农业、生物和化学类等实验室认可申请受理、评审以及后续的监督、扩项和复评活动，并实施监控。承担部分现场评审工作；
3.负责审查评审材料的完整性和符合性，提交认可评定；
4.负责实验室专门委员会及相关专业委员会的管理工作；
5.承担政府委托的资质认定，以及政府、行业和社会委托的相关技术评价等工作；
6.承担对评审员/技术专家进行培训、监督和评价的有关工作；
7.完成中心领导交办的其他工作。
认可监督部
1.归口承担并组织开展政府委托的对认证机构、实验室、检验机构等的监督检查、投诉举报调查等技术支撑工作；
2.归口与认证认可协会行业自律监督活动等的联动并组织开展相关工作；
3.组织开展CNAS专项监督检查工作；
4.组织开展CNAS确认审核工作；
5.负责对已认可的机构及其客户有关的投诉调查处理工作；
6.承担对评审员/技术专家进行培训、监督和评价的有关工作；
7.完成中心领导交办的其他工作。