著作权的产生是随作品产生而产生的，因此相比商标权和外观设计专利权而言，属于在先权利。按照我国《商标法》和《专利法》的相关规定，与他人在先权利相冲突的商标和外观设计专利可以被撤销和无效。所以，如果一件美术作品(如图形)被他人申请注册为商标，或者一个图形商标被他人在别的类别上抢注，此时，利用在先权利进行异议或撤销，可能性就比较大。
著作权登记也能保护权利人的相关经济利益。随着著作权保护意识的提高，使用者在取得授权时，需要对方提供相应的证明，以减少经济风险。在传统的使用作品的领域，人们对作品的认定有一个基本判断。但网络中，常常会出现难以确定权利人的情形，如果取得版权登记证书，问题就容易解决。
成功通过版权登记申请，可以有效的保护作者以及其他著作权人的合法权益。如果是未登记的版权作品，通常在产生纠纷之时，权利人往往会出现举证困难等问题，所以各国纷纷鼓励作者对于作品，特别是计算机软件之类的作品的版权进行登记，以对应日后出现纠纷之时更好的保护作者的权利，在司法诉讼中作为一个有效的权利证明。
进行版权登记后会得到相应的作品登记证书，可以在版权交易时作为主张权利的证明文件;当遇到被抄袭等版权侵权纠纷时，这就是证明自己的证据。另外，办理软件著作权登记的企业可享受国家各种优惠政策，还是“双软认定”的前提条件。版权可作为技术出资入股、体现企业实力等作用。